Мне кажется причинами Смутного времени были следующие факторы
а) кризис всей системы монархии, во многом основанный на системы выдачи земли в обмен на службу. Постепенно контроль центра ослаб и владельцы стали считать эти земли родовыми.
б)Слабостью управленческого аппарата, в котором ключевые позиции занимали не чиновники или хотя бы выдвиженцы царя, а аристократы по праву рождения (все таки дьяков было немного)
в) силой аристократии, по прежнему игравшей серьезную роль в управлении страной
г) слабостью армии (дворянское ополчение как основа армии выглядело слабее чем профессиональные наемники поляков и шведов)
д) разорение Иваном Грозным своей страны (репрессии, неудачные войны,
повышение налогов)
ж) фактическое введение крепостного права (заповедные лета)
з) климатические условия (двухлетний голод)
и) слабость династии (кстати говоря, выдача замуж Ксении создавала соперника
Федору, а его брак с одной из боярских дочерей мог временно укрепить его власть, но создавал угрозу усиления у трона одного рода, который мог со временем скинуть не слишком высокородного царя).
ну и смерть Бориса сыграла тут большую роль.
Хотя последнее скорее сыграло роль повода.